Tradycyjne:
- alfabetyczny (matematyczny, informatyczny)
- rzeczowy (wg klasyfikacji AMS)
- alfabetyczny czasopism (matematyczny, informatyczny)
Elektroniczne:
- zdigitalizowany matematyczny katalog kartkowy
- elektroniczny katalog informatyczny
- zautomatyzowany system biblioteczny VTLS/Virtua (opracowanie, wypożyczanie)
Od 2009 roku biblioteka współuczestniczy w tworzeniu Narodowego Uniwersalnego Katalogu Centralnego (NUKAT), dzięki czemu ma możliwość pobierania gotowych opisów bibliograficznych oraz wprowadzania nowych rekordów bibliograficznych do wykorzystania przez inne polskie biblioteki naukowe i akademickie.
